[r] “패키지 ‘xxx’를 사용할 수 없습니다 (R 버전 xyz)”경고를 어떻게 처리해야합니까?

1. 철자를 쓸 수 없습니다

가장 먼저 테스트 할 것은 패키지 이름의 철자를 정확히 입력 했습니까? 패키지 이름은 R에서 대소 문자를 구분합니다.

2. 당신은 올바른 저장소를 보지 않았다

다음으로 패키지가 사용 가능한지 확인해야합니다. 유형

setRepositories()

? setRepositories 도 참조하십시오 .

R이 어떤 저장소를 찾아 패키지를 찾고 선택적으로 추가 저장소를 선택하십시오. 최소한, 당신은 일반적으로 선택하고 CRAN, CRAN (extras)Windows를 사용하는 Bioc*경우 , 저장소를 사용하는 경우[gen / prote / metabol / transcript] omics 생물학적 분석.

영구적으로 변경하려면, 같은 줄을 추가 setRepositories(ind = c(1:6, 8))하여에 Rprofile.site파일.

3. 패키지가 선택한 리포지토리에 없습니다

사용 가능한 모든 패키지를 사용하여 반환

ap <- available.packages()

R의 사용 가능한 패키지 이름 , ? available.packages 도 참조하십시오 .

이것은 큰 행렬이므로 데이터 뷰어를 사용하여 검사 할 수 있습니다. 또는 행 이름을 테스트하여 패키지가 사용 가능한지 빠르게 확인할 수 있습니다.

View(ap)
"foobarbaz" %in% rownames(ap)

또는 CRAN , CRAN (extras) , Bioconductor , R-forge , RForge 및 github 용 브라우저에서 사용 가능한 패키지 목록을 볼 수 있습니다 .

CRAN 미러와 상호 작용할 때 나타날 수있는 또 다른 경고 메시지는 다음과 같습니다.

Warning: unable to access index for repository

선택한 CRAN 저장소를 현재 사용할 수 없음을 나타낼 수 있습니다. 다른 미러를 선택 chooseCRANmirror()하고 설치를 다시 시도 할 수 있습니다 .

패키지를 사용할 수없는 데는 몇 가지 이유가 있습니다.

4. 당신은 패키지를 원하지 않습니다

아마도 당신은 정말로 패키지를 원하지 않을 것입니다. 패키지와 라이브러리 또는 패키지와 데이터 세트 의 차이점에 대해 혼동되는 것이 일반적 입니다.

패키지는 코드, 데이터 또는 문서 제공과 같이 R을 확장하는 표준화 된 자료 모음입니다. 라이브러리는 R이 사용할 수있는 패키지를 찾는 곳 (디렉토리)입니다

사용 가능한 데이터 세트를 보려면 다음을 입력하십시오.

data()

5. R 또는 바이오 컨덕터가 오래되었습니다

최신 버전의 R (또는 가져 오거나 의존하는 패키지 중 하나)에 종속 될 수 있습니다. 보다

ap["foobarbaz", "Depends"]

R 설치를 현재 버전으로 업데이트하십시오. Windows에서 이것은 installr패키지 를 통해 가장 쉽게 수행됩니다 .

library(installr)
updateR()

(물론 install.packages("installr")먼저 해야 할 수도 있습니다 .)

Bioconductor 패키지와 마찬가지로 Bioconductor 설치를 업데이트해야 할 수도 있습니다.

source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("BiocUpgrade")

6. 패키지가 오래되었습니다

보관 되지 않았을 수 있습니다 (더 이상 유지되지 않고 더 이상 R CMD check테스트를 통과하지 못한 경우 ).

이 경우 다음을 사용하여 이전 버전의 패키지를로드 할 수 있습니다 install_version()

library(remotes)
install_version("foobarbaz", "0.1.2")

대안은 github CRAN 미러에서 설치하는 것입니다.

library(remotes)
install_github("cran/foobarbaz")

7. Windows / OS X / Linux 바이너리가 없습니다

그것은이 없을 수 있습니다 윈도우 바이너리를 인해 CRAN이없는 것을 추가 소프트웨어를 필요로합니다. 또한 일부 패키지는 일부 또는 모든 플랫폼의 소스를 통해서만 사용할 수 있습니다. 이 경우 CRAN (extras)리포지토리에 버전이있을 수 있습니다 ( setRepositories위 참조 ).

패키지에 컴파일 코드 (예 : C, C ++, FORTRAN)가 필요한 경우 Windows 설치 Rtools 또는 OS X에서 XCode와 함께 개발자 도구를 설치하고 다음을 통해 패키지의 소스 버전을 설치하십시오.

install.packages("foobarbaz", type = "source")

# Or equivalently, for Bioconductor packages:
source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("foobarbaz", type = "source")

CRAN에서는 NeedsCompilation설명 의 플래그를 보고 소스에서 패키지를 빌드하기위한 특수 도구가 필요한지 알 수 있습니다 .

8. 패키지는 github / Bitbucket / Gitorious에 있습니다.

Github / Bitbucket / Gitorious에 리포지토리가있을 수 있습니다. 이러한 패키지에는 remotes패키지를 설치해야합니다.

library(remotes)
install_github("packageauthor/foobarbaz")
install_bitbucket("packageauthor/foobarbaz")
install_gitorious("packageauthor/foobarbaz")

(와 마찬가지로 먼저 installr해야 할 수도 있습니다 install.packages("remotes").)

9. 패키지의 소스 버전이 없습니다

패키지의 이진 버전을 사용할 수 있지만 소스 버전은 사용할 수 없습니다. 설정을 통해이 확인을 끌 수 있습니다

options(install.packages.check.source = "no")

에 기재된 imanuelc하여이 SO 응답 과의 세부 단면도 ?install.packages.

10. 패키지가 비표준 저장소에 있습니다.

패키지가 비표준 저장소 (예 :)에 Rbbg있습니다. CRAN 표준을 준수하는 것으로 가정하면 다음을 사용하여 계속 다운로드 할 수 있습니다 install.packages. 리포지토리 URL 만 지정하면됩니다.

install.packages("Rbbg", repos = "http://r.findata.org")

RHIPE반면에 CRAN과 같은 저장소에는 없으며 자체 설치 지침이 있습니다.

답변

install.packages("lubridate", dependencies=TRUE, repos='http://cran.rstudio.com/')

options(download.file.method = "wget")

install.packages('package-name',repos='http://cran.us.r-project.org')

packages <- function(pkg){
    new.pkg <- pkg[!(pkg %in% installed.packages()[, "Package"])]
    if (length(new.pkg))
        install.packages(new.pkg, dependencies = TRUE, repos='https://cran.rstudio.com/')
    sapply(pkg, require, character.only = TRUE)
}

packages(c("foo", "bar", "baz"))