[python] numpy 배열에서 가장 가까운 값 찾기
배열에서 가장 가까운 값 을 찾는 함수와 같은 수많은 방식이 있습니까?
예:
np.find_nearest( array, value )
답변
import numpy as np
def find_nearest(array, value):
array = np.asarray(array)
idx = (np.abs(array - value)).argmin()
return array[idx]
array = np.random.random(10)
print(array)
# [ 0.21069679 0.61290182 0.63425412 0.84635244 0.91599191 0.00213826
# 0.17104965 0.56874386 0.57319379 0.28719469]
value = 0.5
print(find_nearest(array, value))
# 0.568743859261
답변
경우 배열을 정렬하고 매우 큰되고, 이것은 훨씬 빠른 솔루션입니다 :
def find_nearest(array,value):
idx = np.searchsorted(array, value, side="left")
if idx > 0 and (idx == len(array) or math.fabs(value - array[idx-1]) < math.fabs(value - array[idx])):
return array[idx-1]
else:
return array[idx]
이것은 매우 큰 배열로 확장됩니다. 배열이 이미 정렬되어 있다고 가정 할 수없는 경우 위의 방법으로 정렬하여 쉽게 정렬 할 수 있습니다. 작은 어레이에는 과잉이지만, 일단 커지면 훨씬 빠릅니다.
답변
약간 수정하면 위의 대답은 임의의 차원 (1d, 2d, 3d, …)의 배열에서 작동합니다.
def find_nearest(a, a0):
"Element in nd array `a` closest to the scalar value `a0`"
idx = np.abs(a - a0).argmin()
return a.flat[idx]
또는 한 줄로 작성하십시오.
a.flat[np.abs(a - a0).argmin()]
답변
답변 요약 : 정렬 된 array
경우 이분법 코드 (아래 제공)가 가장 빠릅니다. 대형 어레이의 경우 ~ 100-1000 배, 소형 어레이의 경우 ~ 2-100 배 더 빠릅니다. numpy도 필요하지 않습니다. 분류되지 않은 array
경우 array
큰 경우 먼저 O (n logn) 정렬을 사용한 다음 이분법을 고려해야하며, array
작 으면 방법 2가 가장 빠릅니다.
먼저 가장 가까운 값으로 의미를 명확히해야합니다 . 가로축의 간격을 원할 때가 종종 있습니다 (예 : array = [0,0.7,2.1], value = 1.95, answer는 idx = 1입니다. 이것은 내가 필요하다고 생각하는 경우입니다 (그렇지 않으면 간격을 찾으면 후속 조건문을 사용하여 다음을 매우 쉽게 수정할 수 있습니다). 이 작업을 수행하는 최적의 방법은 이분법을 사용하는 것입니다 (먼저 제공 할 것입니다-전혀 numpy가 필요하지 않으며 중복 작업을 수행하기 때문에 numpy 함수를 사용하는 것보다 빠릅니다). 그런 다음 다른 사용자가 여기에 제시 한 다른 것과의 타이밍 비교를 제공합니다.
이등분:
def bisection(array,value):
'''Given an ``array`` , and given a ``value`` , returns an index j such that ``value`` is between array[j]
and array[j+1]. ``array`` must be monotonic increasing. j=-1 or j=len(array) is returned
to indicate that ``value`` is out of range below and above respectively.'''
n = len(array)
if (value < array[0]):
return -1
elif (value > array[n-1]):
return n
jl = 0# Initialize lower
ju = n-1# and upper limits.
while (ju-jl > 1):# If we are not yet done,
jm=(ju+jl) >> 1# compute a midpoint with a bitshift
if (value >= array[jm]):
jl=jm# and replace either the lower limit
else:
ju=jm# or the upper limit, as appropriate.
# Repeat until the test condition is satisfied.
if (value == array[0]):# edge cases at bottom
return 0
elif (value == array[n-1]):# and top
return n-1
else:
return jl
이제 다른 답변에서 코드를 정의하고 각각 인덱스를 반환합니다.
import math
import numpy as np
def find_nearest1(array,value):
idx,val = min(enumerate(array), key=lambda x: abs(x[1]-value))
return idx
def find_nearest2(array, values):
indices = np.abs(np.subtract.outer(array, values)).argmin(0)
return indices
def find_nearest3(array, values):
values = np.atleast_1d(values)
indices = np.abs(np.int64(np.subtract.outer(array, values))).argmin(0)
out = array[indices]
return indices
def find_nearest4(array,value):
idx = (np.abs(array-value)).argmin()
return idx
def find_nearest5(array, value):
idx_sorted = np.argsort(array)
sorted_array = np.array(array[idx_sorted])
idx = np.searchsorted(sorted_array, value, side="left")
if idx >= len(array):
idx_nearest = idx_sorted[len(array)-1]
elif idx == 0:
idx_nearest = idx_sorted[0]
else:
if abs(value - sorted_array[idx-1]) < abs(value - sorted_array[idx]):
idx_nearest = idx_sorted[idx-1]
else:
idx_nearest = idx_sorted[idx]
return idx_nearest
def find_nearest6(array,value):
xi = np.argmin(np.abs(np.ceil(array[None].T - value)),axis=0)
return xi
이제 코드의 시간을 정하겠습니다.
참고 방법 1,2,4,5는 간격을 올바르게 지정하지 않습니다. 방법 1,2,4는 배열에서 가장 가까운 점으로 반올림하고 (예 :> = 1.5-> 2), 방법 5는 항상 반올림합니다 (예 : 1.45-> 2). 방법 3, 6 및 물론 이분법 만 구간을 적절하게 제공합니다.
array = np.arange(100000)
val = array[50000]+0.55
print( bisection(array,val))
%timeit bisection(array,val)
print( find_nearest1(array,val))
%timeit find_nearest1(array,val)
print( find_nearest2(array,val))
%timeit find_nearest2(array,val)
print( find_nearest3(array,val))
%timeit find_nearest3(array,val)
print( find_nearest4(array,val))
%timeit find_nearest4(array,val)
print( find_nearest5(array,val))
%timeit find_nearest5(array,val)
print( find_nearest6(array,val))
%timeit find_nearest6(array,val)
(50000, 50000)
100000 loops, best of 3: 4.4 µs per loop
50001
1 loop, best of 3: 180 ms per loop
50001
1000 loops, best of 3: 267 µs per loop
[50000]
1000 loops, best of 3: 390 µs per loop
50001
1000 loops, best of 3: 259 µs per loop
50001
1000 loops, best of 3: 1.21 ms per loop
[50000]
1000 loops, best of 3: 746 µs per loop
큰 배열의 이분법은 다음 최고 180us 및 가장 긴 1.21ms (~ 100-1000 배 더 빠름)에 비해 4us를 제공합니다. 더 작은 어레이의 경우 ~ 2-100 배 빠릅니다.
답변
다음은 벡터 배열에서 가장 가까운 벡터를 찾는 확장 기능입니다.
import numpy as np
def find_nearest_vector(array, value):
idx = np.array([np.linalg.norm(x+y) for (x,y) in array-value]).argmin()
return array[idx]
A = np.random.random((10,2))*100
""" A = array([[ 34.19762933, 43.14534123],
[ 48.79558706, 47.79243283],
[ 38.42774411, 84.87155478],
[ 63.64371943, 50.7722317 ],
[ 73.56362857, 27.87895698],
[ 96.67790593, 77.76150486],
[ 68.86202147, 21.38735169],
[ 5.21796467, 59.17051276],
[ 82.92389467, 99.90387851],
[ 6.76626539, 30.50661753]])"""
pt = [6, 30]
print find_nearest_vector(A,pt)
# array([ 6.76626539, 30.50661753])
답변
numpy를 사용하지 않으려면 다음을 수행하십시오.
def find_nearest(array, value):
n = [abs(i-value) for i in array]
idx = n.index(min(n))
return array[idx]
답변
스칼라 이외의 “값”배열을 처리하는 버전은 다음과 같습니다.
import numpy as np
def find_nearest(array, values):
indices = np.abs(np.subtract.outer(array, values)).argmin(0)
return array[indices]
또는 입력이 스칼라 인 경우 숫자 유형 (예 : int, float)을 반환하는 버전 :
def find_nearest(array, values):
values = np.atleast_1d(values)
indices = np.abs(np.subtract.outer(array, values)).argmin(0)
out = array[indices]
return out if len(out) > 1 else out[0]